Sekundärrohstoffdünger (SEROs) wie z.B. Klärschlämme, Komposte und Fleischknochenmehle werden hauptsächlich im außerlandwirtschaftlichen Bereich erzeugt und stellen z.T. hochwertige organische Dünger dar. Für den gezielten Einsatz sollte eine Nährstoffanalyse erfolgen. Zu beachten ist, dass die meisten Nährstoffe nicht in sofort pflanzenverfügbarer Form vorliegen und deshalb eine längere Wirkungsdauer einzuplanen ist. Hauptsächlich werden die Dünger zur Verbesserung der Grundnährstoffversorgung eingesetzt. Je nach Herkunft und Behandlung schwanken die Nährstoffgehalte. Eine homogene Durchmischung der SEROs erhöht die Düngewirkung. Der Einsatz von SEROs wird durch Ausbringverbote, Abstandsauflagen, Sperrfristen, Nährstoffuntersuchungen und -vergleiche durch die Düngeverordnung beschränkt.
Klärschlämme, Komposte und Fleischknochenmehle unterliegen sowohl abfallrechtlichen als auch düngemittelrechtlichen Bestimmungen.